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內(nèi)參cq值一般多少合適(內(nèi)參gapdhct值多大比較好)
大家好!今天讓創(chuàng)意嶺的小編來大家介紹下關于內(nèi)參cq值一般多少合適的問題,以下是小編對此問題的歸納整理,讓我們一起來看看吧。
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本文目錄:
一、qRT-PCR檢測植物miRNA的表達量,內(nèi)參基因選擇什么最好?可以給出特意反轉錄引物和qRT-PCR的引物嗎?
我知道和使用過的U6內(nèi)參基因只有兩個: RNU6-1和RNU6-2.前一個就是常見的u6,后一個有時被稱為u6b. 在我的大鼠RNA樣本當中,u6表達量有些太高,u6b的Cq值與我的目標miRNA比較接近,穩(wěn)定性也很好。但是這些對植物樣本中的內(nèi)參基因選擇沒有什么指導意義。
為了確定u6在植物中的保守性,比較快捷的辦法是找到談論這個話題的文獻綜述。如果沒有人寫過這樣的綜述的話,就只能靠自己去數(shù)據(jù)庫找到所有序列自己對比了。
關于內(nèi)參基因的選擇,必須實驗確定特定樣本中的表達水平穩(wěn)定,其他文獻中報導的內(nèi)參基因不一定適合你的樣本。做新的課題時,選擇內(nèi)參基因一般是選取3-5個常用的,PCR測試后選取。
這里有applied biosystem一篇非常好的文章討論內(nèi)參基因,里面有很多建議和備選,但都是人和小鼠中測試的。我貼鏈接不方便,麻煩你自己把點和斜換成標點以后使用:
www3點appliedbiosystems點com斜cms斜groups斜mcb_marketing斜documents斜generaldocuments斜cms_044972點pdf
以上公司的miR PCR是莖環(huán)法,也是我使用過的,兩個引物不在同一個管內(nèi),兩個步驟也是完全分開先后進行的。暫時沒有看到他們有內(nèi)參和目標基因在同一反應管進行的miR PCR產(chǎn)品, 因為他們的PCR探針都用的同一種熒光。如果樓主感興趣RT-PCR一步反應的,并且內(nèi)參能夠與目標miR在同一反應體系進行的產(chǎn)品,還要去咨詢各大廠商。
二、熒光PCR時ct值大于30?
看了你空間里的溶解曲線,你可以看到溶解峰的溫度都很低,全在80以下,你擴出來的東西多半只是引物,你跑定量的時候有做NTC的孔嗎,如果有做,可以對照NTC組和加了模板的組,溶解峰還是一樣的話,那你擴出來的產(chǎn)物100%是引物了。
再有,你的擴增曲線問題,CT太了,一般做定量認為CT=25時,是一個模板擴出來的,所以當大于25擴出來的結果都不可信。
還有,你反轉錄的時候RNA加多少,2微克?,反轉錄體系是多少,20微升?反轉錄之后按照多少比例稀釋,1比4?
總之,問題可以再問詳細一點,也可以直接HI我
如果做過NTC那溶解峰就沒問題了,而且都很單一,特異性蠻好的。沒稀釋的cDNA做的定量,CT大于30?你P的什么基因呢,表達量也太低了吧,內(nèi)參的CT呢,也是這么低嗎
三、小鼠14-3-3 zeta的內(nèi)參基因選什么
我知道和使用過的U6內(nèi)參基因只有兩個:RNU6-1和RNU6-2.前一個就是常見的u6,后一個有時被稱為u6b.在我的大鼠RNA樣本當中,u6表達量有些太高,u6b的Cq值與我的目標miRNA比較接近,穩(wěn)定性也很好.但是這些對植物樣本中的內(nèi)參基因選擇沒有什么指導意義.
為了確定u6在植物中的保守性,比較快捷的辦法是找到談論這個話題的文獻綜述.如果沒有人寫過這樣的綜述的話,就只能靠自己去數(shù)據(jù)庫找到所有序列自己對比了.
關于內(nèi)參基因的選擇,必須實驗確定特定樣本中的表達水平穩(wěn)定,其他文獻中報導的內(nèi)參基因不一定適合你的樣本.做新的課題時,選擇內(nèi)參基因一般是選取3-5個常用的,PCR測試后選取.
這里有applied biosystem一篇非常好的文章討論內(nèi)參基因,里面有很多建議和備選,但都是人和小鼠中測試的.我貼鏈接不方便,麻煩你自己把點和斜換成標點以后使用:
www3點appliedbiosystems點com斜cms斜groups斜mcb_marketing斜documents斜generaldocuments斜cms_044972點pdf
以上公司的miR PCR是莖環(huán)法,也是我使用過的,兩個引物不在同一個管內(nèi),兩個步驟也是完全分開先后進行的.暫時沒有看到他們有內(nèi)參和目標基因在同一反應管進行的miR PCR產(chǎn)品,因為他們的PCR探針都用的同一種熒光.如果樓主感興趣RT-PCR一步反應的,并且內(nèi)參能夠與目標miR在同一反應體系進行的產(chǎn)品,還要去咨詢各大廠商.
如果你對這個答案有什么疑問,請追問,
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四、cq值高應該降低模版濃度嗎
應該的,cq值高應該降低模版濃度的,因為cq值高降低模版濃度是正常的,也是必須的,所以cq值高應該降低模版濃度
以上就是關于內(nèi)參cq值一般多少合適相關問題的回答。希望能幫到你,如有更多相關問題,您也可以聯(lián)系我們的客服進行咨詢,客服也會為您講解更多精彩的知識和內(nèi)容。
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