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內(nèi)參actin(內(nèi)參actin和gapdh)
大家好!今天讓創(chuàng)意嶺的小編來大家介紹下關(guān)于內(nèi)參actin的問題,以下是小編對(duì)此問題的歸納整理,讓我們一起來看看吧。
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本文目錄:
一、western blot內(nèi)參抗體actin為什么出了好幾條帶
首先要確定你的樣品沒有降解,基本上看帶型可以確定,條帶要干凈,沒有拖尾,其次是你的一抗,這個(gè)需要跟別個(gè)同學(xué)做的對(duì)比,這兩個(gè)問題排除后主要就是你的抗體稀釋度了,濃度過高,顯影底物過強(qiáng)都會(huì)出現(xiàn)雜帶,而雜帶跟你每次操作包括洗脫的時(shí)間 孵育的時(shí)間的不同,都可能出現(xiàn)在不同的位置
二、RT-PCR是,內(nèi)參是什么時(shí)候加入,作用是什么?謝謝
你說的應(yīng)該是real
time
pcr吧,注意rt其實(shí)是逆轉(zhuǎn)錄reverse
transcription的縮寫,和real
time一定要分開來。
常說的qpcr,qrt-pcr,都是通過實(shí)時(shí)(real
time)的方法,測(cè)定樣品中某個(gè)模版的起始量ct值
但是呢,由于之前rna提取、反轉(zhuǎn)等步驟,各個(gè)步驟存在不同的效率,ct值并無法真實(shí)反應(yīng)樣品中模版的絕對(duì)量,因此,需要一個(gè)內(nèi)參來做為參考。
比方說,a基因的ct值,在a樣品中是18,在b樣品中是20,由于a
b樣品存在rna質(zhì)量等等一系列不同,你無法直接就判斷這個(gè)基因在a樣品中的表達(dá)量是b樣品的4倍。
這時(shí)候,我們需要一個(gè)內(nèi)參,假如內(nèi)參ct值在a樣品中是14,而在b樣品中是15。由于內(nèi)參的穩(wěn)定性,在不同樣品中被認(rèn)為是表達(dá)量一致的,因此,a基因的在ab樣品之間的-δδct值是1,也就是表達(dá)量為2倍的關(guān)系。
這里,我們可以知道內(nèi)參的作用,即通過測(cè)量?jī)?nèi)參,可以在后面分析過程中將不同樣品的起始量均一化。內(nèi)參需要選擇在不同樣品中有穩(wěn)定表達(dá)量的基因,這就是為什么內(nèi)參經(jīng)常選擇看家基因的原因。以小鼠為例,常用的內(nèi)參有actin
gapdh
hprt等等。
當(dāng)然,現(xiàn)在的很多觀點(diǎn)認(rèn)為這些基因在不同組織中豐度也不同,例如gapdh,在線粒體含量高的組織中豐度高,很多人認(rèn)為用基因組dna做內(nèi)參會(huì)更加靠譜,當(dāng)然這是后話了,選擇gapdh無礙于現(xiàn)階段的實(shí)驗(yàn),如果覺得不靠譜,可以選擇兩個(gè)內(nèi)參。
你所研究的物種,應(yīng)該有人已經(jīng)發(fā)表過相應(yīng)的內(nèi)參,直接上數(shù)據(jù)庫(kù)搜就可以了。
原創(chuàng)內(nèi)容,碼字不易,萬望采納。
三、求助水稻的actin 內(nèi)參基因引物
ACTIN在研究中被發(fā)現(xiàn)最不穩(wěn)定 引物為:
Forward GAAGATCACTGCCTTGCTCC
Reverse CGATAACAGCTCCTCTTGGC
其他較好的水稻內(nèi)參基因?yàn)椋?/p>
18S rRNA
Forward ATGATAACTCGACGGATCGC
Reverse CTTGGATGTGGTAGCCGTTT
Glyceraldehyde-3-hosphate dehydrogenase
Forward GGGCTGCTAGCTTCAACATC
Reverse TTGATTGCAGCCTTGATCTG
Tubulin
Forward TACCGTGCCCTTACTGTTCC
Reverse CGGTGGAATGTCACAGACAC
出自一下文章:
《Normalization of reverse transcription quantitative-PCR with
housekeeping genes in rice》
你可以上網(wǎng)下載自己好好研究下
內(nèi)參基因?qū)τ趯?shí)時(shí)定量的結(jié)果非常重要 要慎重選擇
四、請(qǐng)問內(nèi)參β-actin在血細(xì)胞里面也有表達(dá)嗎?特別是紅細(xì)胞,里面有嗎?
都表達(dá),他們的基因都是組成型基因,每種組織都會(huì)表達(dá)。所以紅細(xì)胞里面也有。
以上就是關(guān)于內(nèi)參actin相關(guān)問題的回答。希望能幫到你,如有更多相關(guān)問題,您也可以聯(lián)系我們的客服進(jìn)行咨詢,客服也會(huì)為您講解更多精彩的知識(shí)和內(nèi)容。
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